Beacon designer怎么使用 提交软件配套服务

北京天演融智软件有限公司

HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的较佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的较短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特异性。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。

自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。



具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的较佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的较短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特异性。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质：
Ÿ TaqMan探针


Beacon Designer 为qPCR检验设计**和高效的oligos
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
Specific and Efficient Design: How Beacon Designer™ Makes it Possible?
You can BLAST search sequences and search for template structures from within the program. The results of both these searches are used while designing primers and probes. The regions that exhibit significant cross homologies and template structures are avoided automatically during the design.

具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。



双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质：
 TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
 Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术，可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。
Scorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的，它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。
FRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。
使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
Ÿ Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术，可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。


ŸScorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的，它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。


ŸFRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。


Ÿ多路实时PCR检验
有了Beacon Designer，您可以设计基于TaqMan的多路复用实时PCR检验，包括参考基因选择。


自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。

具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。

Beacon Designer 为qPCR检验设计**和高效的oligos


具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中较常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物，帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数，或者您可以使用默认值，在经过大量的研究和与*的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外，信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。
Automate Your Real Time PCR Primer and Probe Design
Beacon Designer™ automates the design of real time primers and probes. It is used by molecular biologists worldwide to design successful real time PCR assays. It saves the time and the money involved in failed experiments. Beacon Designer™ is a flexible solution to your real time primer and probe design needs and pays for itself many times over.

Beacon Designer 为qPCR检验设计**和高效的oligos
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
具体而有效的设计：Beacon Designer如何使其成为可能
您可以在程序中使用BLAST搜索序列并搜索模板结构。在设计引物和探针时使用这两种搜索的结果。在设计过程中，会自动避免出现明显的交叉同源性和模板结构的区域。
utomate Your Real Time PCR Primer and Probe Design
Beacon Designer™ automates the design of real time primers and probes. It is used by molecular biologists worldwide to design successful real time PCR assays. It saves the time and the money involved in failed experiments. Beacon Designer™ is a flexible solution to your real time primer and probe design needs and pays for itself many times over.
可用的设计选项
SYBR Green试验设计
SYBR Green可能是实时PCR化学中较常用的。Beacon Designer设计SYBR Green PCR引物，帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数，或者您可以使用默认值，在经过大量的研究和与*的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外，信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。
HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的较佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的较短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特异性。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。
SYBR® Green Primer Design
TaqMan® Probe Design
Multiplex Real Time PCR Assay Design
HRMA Primer Design
MethyLight TaqMan® Design
Molecular Beacon Design
NASBA® Assay Design
FRET Probe Design
Scorpions® Design
Avoiding Cross Homology- For Specific Oligo Design
Avoid Template Structures- Increase Primer Efficiency
Oligo Rating
帮助您评估预先设计的SYBR Green PCR引物集。您可以完全控制设计参数，或者您可以使用默认值，在经过大量的研究和与*的交流之后选择。您甚至可以为您的特定研究需求选择您自己的默认设计参数。
除了在感兴趣的基因上定位引物外，信标设计者还可以设计外显子或外显子内含子连接的引物。这些引物设计的外显子内含子连接有助于选择性帮助从gDNA选择性扩增cDNA。

自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。



HRMA试验设计
Beacon Designer为突变检测提供了一个综合解决方案。高分辨率熔解分析（HRMA）是一种比基于**腺的基因型分析更具有成本效益的方法。该程序使用专有算法，可以设计出检测突变的较佳引物。
高分辨率的熔解分析引物被设计成侧翼感兴趣突变，产生具有可检测的熔融温度变化的较短可能的扩增子。引物设计避免了模板二级结构，保证有效引物延伸。设计的HRMA引物可以在NCBI的核苷酸数据库中进行搜索，以检验其特异性。还可以对预先设计或发布的引物进行分析。